Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms