Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
ODF1Q14990 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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ODF1Q14990 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
ODF1Q14990 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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