Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDH18Q13634 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDH18Q13634 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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