Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
C1orf61Q13536 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
C1orf61Q13536 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms