Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TCOF1Q13428 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TCOF1Q13428 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TCOF1Q13428 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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TCOF1Q13428 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
TCOF1Q13428 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TCOF1Q13428 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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