Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
MKRN3Q13064 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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