Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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GTF3C1Q12789 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF3C1Q12789 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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