Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CPSF1Q10570 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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