Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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C9orf172C9J069 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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C9orf172C9J069 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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C9orf172C9J069 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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C9orf172C9J069 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
C9orf172C9J069 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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