Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LINC00587B1AMM8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LINC00587B1AMM8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms