Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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COPS7AQ9UBW8 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
COPS7AQ9UBW8 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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