Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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USP35Q9P2H5 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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