Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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