Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRERF1Q96PN7 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRERF1Q96PN7 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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