Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZBED3Q96IU2 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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ZBED3Q96IU2 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ZBED3Q96IU2 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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