Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RNF34Q969K3 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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