Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP76-201ENST00000364419 323 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 TRBV7-7-201ENST00000390377 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SL798P-201ENST00000468562 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC025252.2-201ENST00000537470 502 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD39Q53RE8 AP000915.2-201ENST00000582120 454 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms