Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms