Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FSCN1Q16658 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FSCN1Q16658 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms