Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYPL1Q16563 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms