Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GRIK5Q16478 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms