Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SSX1Q16384 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SSX1Q16384 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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