Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SS18Q15532 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SS18Q15532 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SS18Q15532 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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SS18Q15532 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SS18Q15532 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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