Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
PTPRKQ15262 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PTPRKQ15262 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms