Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMCO1Q147U7 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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