Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SCARB2Q14108 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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SCARB2Q14108 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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