Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms