Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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