Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HTR4Q13639 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HTR4Q13639 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms