Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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