Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms