Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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CBX3Q13185 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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CBX3Q13185 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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CBX3Q13185 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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