Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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RPA4Q13156 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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RPA4Q13156 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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RPA4Q13156 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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RPA4Q13156 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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RPA4Q13156 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
RPA4Q13156 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
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RPA4Q13156 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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RPA4Q13156 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
RPA4Q13156 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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