Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CPSF1Q10570 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CPSF1Q10570 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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