Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRDP23468 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRDP23468 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRDP23468 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRDP23468 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRDP23468 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRDP23468 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTPRDP23468 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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