Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN9O95484 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN9O95484 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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