Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SAMD8Q96LT4 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SAMD8Q96LT4 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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SAMD8Q96LT4 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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