Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
USP53Q70EK8 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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USP53Q70EK8 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
USP53Q70EK8 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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