Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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PTPRNQ16849 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRNQ16849 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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