Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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DDB1Q16531 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
DDB1Q16531 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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