Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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