Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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TWIST1Q15672 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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TWIST1Q15672 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
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TWIST1Q15672 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TWIST1Q15672 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TWIST1Q15672 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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