Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms