Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
R3HDM1Q15032 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms