Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SMC1AQ14683 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms