Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CTTNQ14247 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms