Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
SPTAN1Q13813 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
SPTAN1Q13813 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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