Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
APOFQ13790 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
APOFQ13790 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms