Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NEUROD1Q13562 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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