Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ATRQ13535 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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